При синтезе пептидов могут применяться разные типы нагрева.
Микроволновой нагрев применялся в синтезаторах AAPPTec Infinity 2400, CEM Liberty и др.
Градиентный нагрев включен в качестве опции во все синтезаторы AAPPTec семейства Focus.
Таблица 1. Чистота получаемых сырых пептидов при разных методах нагрева.
Пептид |
Комнатная температура |
Микроволновой нагрев |
Градиентный нагрев |
Задержанный градиент |
ACP (65-74)a |
89.4% |
92.3% |
93.1% |
95.2% |
JR 10-merb |
62.1% |
68.4% |
80.5% |
91.2% |
Thymosin α1c |
68.8% |
60.8% |
74.2% |
77.6% |
HIV tatd |
78.9% |
81% |
80.9% |
86.6% |
|
93.1% |
82.3% |
94.7% |
96.1% |
aVQAAIDYING-NH2 bWFTTLISTIM-NH2 cSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAEN-NH2 dGKKKRRQRRRPQ-NH2 eGVRGDKGNPGWPGAPY-NH2
Таким образом, экспериментальные данные свидетельствуют, что задержанный градиентный нагрев позволяет получить наиболее качественные сырые пептиды по сравнению с микроволновым нагревом и обычной комнатной температурой.
Если в дополнение к задержанному градиентному нагреву использовать программу Predicted Coupling Efficiency (Эффективное предсказуемое соединение), эффективное омывание и определенные виды смолы (например, Octagel), то можно получать самые чистые сырые пептиды из возможных.
Поскольку требуется лишь минимальная очистка пептидов, получаемых при использовании градиентного нагрева (либо можно обойтись вообще без очистки), этот быстрый и эффективный метод является предпочтительным для синтеза пептидов в условиях клиники или госпиталя.