Reco — реконструкция эксперимента 

Reco – набор взаимосвязанных средств визуализации, которые позволяют контролировать и производить анатомо-физиологические корреляции экспериментальных данных.

Если вы когда-либо сталкивались с необходимостью обрисовать места записи или воздействия тока на листе атласа или на изображении гистологического среза с целью повышения уровня понимания полученных электрофизиологических данных, то теперь вы можете получить преимущества от инновационных функций, которые предоставляет комплекс Reco.

Reco интергирован в одну исследовательскую цепь со SpeedSort и neuro-Guide, из которых он импортирует базу Excel для реконструкции местоположений записи в целом эксперименте.

Характерная черта Reco – это создание одной сцены, где три режима визуализации встроены и пространственно синхронизированы:

1. информация об эксперименте (места вживления и траектории);
2. срезы из атласа;
3. гистологические срезы.

Однако, Reco предоставляет несколько полезных функций и кроме реализации такой мультиинформационной сцены. Вы можете использовать различные критерии для фильтрования и создания статистических отчетов, основанных на анализе результатов полученных данных. Также вы можете просматривать базу данных одного или более экспериментов, и для каждого места вживления возможно выявление «характерных» данных, также как анализ локализации места вживления по отношению к определенным ядрам.

Этот инновационный инструмент открывает невиданные возможности для пост-визуализации и оптимального понимания данных электрофизиологических экспериментов.

Анализ экспериментальных данных

Reco импортирует базы данных Excel, созданные SpeedSort. Далее исследования отображаются в структуре дерева: группа (или исследование)/траектория/место вживления.

При выборе траектории программа отображает информацию об этой траектории для каждого места вживления, например:

• глубину вживления,
• всю записанную информацию, относящуюся к характерному классу, определенному в данном сигнале, включая покрытие спайковых зон, форму образца и общий и «типичный» растер нейронной активности,
• первичное геометрическое отношение зоны вживления с целевым ядром («соответствие ядра»).

Непосредственная пространственная синхронизация

Если вы выберете определенное исследование, Reco автоматически найдет лучшее позиционное соответствие между срезами из атласа и матрицей траекторий. То есть программа покажет для каждого релевантного среза из атласа ближайшую экспериментальную траекторию. Срезы могут пролистываться («проигрываться»), и Reco всегда найдет и отобразит наилучшее соответствие.

Каждое место отведения помечается как сфера на соответствующей траектории. Чтобы осуществить пространственное соответствие между пространством эксперимента и пространством атласа, Reco предлагает гибкий набор инструментов геометрического перемещения. Если вы выявили точку вживления на срезе атласа, вы просто синхронизируете свою траекторию с атласом сопоставляя соответствующую точку из базы данных.

Интуитивная визуализация и оптимальная интерактивность

Reco обладает мощными возможностями, гарантирующими оптимальную визуализацию и интерактивность.

Сферы, обозначающие точки отведения автоматически кодируются цветом, на основе значения зарегистрированной активности или коэффициента вариабельности. В другом представлении информация о «соответствие ядра» кодируется с использованием двух цветов.

Программа предлагает интуитивные возможности, повышающие комфортность исследований. Например, если вы выберете место отведения (закодированную цветом сферу) в изображении, Reco выведет соответствующую запись в окне базы данных. Также приложение автоматически находит в подмножестве серии спайков те, которые наилучшим образом отражают общий характер активности, основываясь на среднем коэффициенте вариабельности.

В Reco3D каждый раздел атласа может быть добавлен или удален независимо, предоставляя возможность натурального представления, в котором содержится полностью интерактивная 3D сцена: выбранный участок листов атласа, модель желаемого ядра и траектория с точками записи.

Гибкая статистика

Используя Reco, вы можете гибко создавать наборы точек записи в одном или нескольких экспериментах. Когда набор создан, Reco отображает статистику параметров нейронной активности. Различные критерии фильтрации могут быть применены для включения/исключения точек вживления в/из статистических наборов. Например, данную возможность можно использовать для понимания и оценки статистически доминирующего паттерна нейронной активности в данном ядре или области, основываясь только на сигналах хорошего качества.

Поддержка публикации

Reco не только позволяет визуализировать и понять экспериментальные факты, но также может экспортировать наборы пространственно скоррелированных изображений для целей публикации. Программа подготавливает сцены соответствия атласа и эксперимента, которые вы можете подогнать и сохранить в стандартном формате изображений.